个人简介

邵丹，女，博士，教授，硕士生导师，教育部高等公司产品专家，吉林省D类人才。曾作为访问学者赴美国内布拉斯加州大学林肯分校、加拿大渥太华大学、美国圣路易斯大学访问学习。主要从事机器学习与生物信息学研究，研究兴趣包括蛋白质组学数据挖掘、疾病蛋白标志物分析、医学影像建模分析。主持吉林省自然科学基金面上项目1项、吉林省科技重点研发项目2项；获授权发明专利3项；在《Briefing in Bioinformatics》、《Bioinformatics》、《IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics》等高水平杂志和国际生物信息会议上发表论文20 余篇。获ACM 中国优秀博士论文奖；获吉林省科技进步三等奖2项。担任中国计算机学会CCF教育专委执行委员、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员。

研究方向：

生物信息学、大数据智能计算

联系方式：

shaodan@ccu.edu.cn

荣誉与奖励：

（1）吉林省科技进步三等奖：“基于缩微平台的车联网通信与安全关键技术研究与应用”，排名第1，吉林省科学技术奖励委员会，2020.

（2）吉林省科技进步三等奖：“基于RFID与二维码技术的汽车零部件质量可视化监控与溯源系统”，排名第5，吉林省人民政府，2022.

（3）ACM中国优秀博士论文奖，2021.

（4）吉林省D类人才， 吉林省政府，2024.

代表性学术成果：

1.论文

(1) Dan Shao; Guangzhao Zhang; Lin Lin*; Yucong Xiong; Kai He; Liyan Sun. SecProGNN: predicting bronchoalveolar lavage fluid secreted protein using graph neural network. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2025;

(2) Dan Shao, Yinfei Dai, Nianfeng Li, Xuqing Cao, Wei Zhao, Li Cheng, Zhuqing Rong, Lan Huang, Yan Wang*, Jing Zhao*. Artificial intelligence in clinical research of cancers. Briefings in Bioinformatics. 2022; 23:1-12.

(3) Dan Shao, Lan Huang, Yan Wang*, Kai He, Xueteng Cui, Yao Wang, Qin Ma, Juan Cui*. DeepSec: a deep learning framework for secreted protein discovery in human body fluids. Bioinformatics, 2022; 38:228-235.

(4) Dan Shao, Lan Huang, Yan Wang*, Xueteng Cui, Yufei Li, Yao Wang, Qin Ma, Wei Du, Juan Cui*. HBFP: a new repository for Human Body-Fluid Proteome. Database. 2021; baab065.

(5) Dan Shao, Lan Huang, Yan Wang, Xueteng Cui, Kai He, Yao Wang. Computational prediction of human body-fluid protein. 2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). 2019; 2735-2740.

(6) Dan Shao, Yu Liu, Guoxing Liu, Ning Wang, Pu Chen, Jiaxun Yu and Guangmin Liang*. YOLOv7scb: a small-target object detection method for fire smoke inspection. Fire. 2025; 8, 62.

(7) Dan Shao, Ning Wang, Pu Chen, Yu Liu, Lin Lin*. A novel video compression approach based on two-stage learning. Entropy. 2024; 26, 1110.

(8) Lan Huang, Yanli Qu, Kai He, Yan Wang, Dan Shao*. DenSec: secreted protein prediction in cerebrospinal fluid based on SenseNet and Transformer. Mathematics. 2022; 10:2490.

(9) Lan Huang, Dan Shao, Yan Wang*, Xueteng Cui, Yufei Li, Qian Chen, Juan Cui*. Human body-fluid proteome: quantitative profiling and computational prediction. Briefings in Bioinformatics. 2021; 22:315-333.

(10) Sen Yang, Yan Wang*, Yu Lin, Dan Shao. LncMirNet: predicting LncRNA-miRNA interaction based on deep learning of ribonucleic acid sequences. Molecules. 2022; 25:4372.

(11) Kai He, Yan Wang*, Xuping Xie, Dan Shao. MultiSec: multi-task deep learning improves secreted protein discovery in human body fluids. Mathematics. 2022;10:2562.

(12) Kai He, Yan Wang*, Xuping Xie, Dan Shao. Prediction of proteins in cerebrospinal fluid and application to glioma biomarker identification. Molecules. 2023;28:3617.

2.专利

（1）基于深层神经网络的脑脊液蛋白质的预测方法，2021-05-25，中国，ZL 201911073760.4

（2）基于卷积神经网络的精液蛋白质的预测方法，2021-03-02，中国，ZL 201911073759.1

科研项目：

（1）吉林省科技厅，重点研发项目，20220203057SF，基于数据分析的智慧消防安全管理系统研究，20万，2022.01-2024.12，主持。

（2）吉林省科技厅，自然基金面上项目，20230101236JC，基于PPI网络的肺癌体液标志物深度挖掘与机理分析，10万，2023.01-2025.12，主持。